Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCNAQ96QF7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms