Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB3IPQ96QF0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms