Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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