Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms