Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HDAC11Q96DB2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HDAC11Q96DB2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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