Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNDC1Q96C34 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms