Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCE1Q969G3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCE1Q969G3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms