Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms