Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms