Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSDMBQ8TAX9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms