Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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