Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT2Q8N9I0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT2Q8N9I0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms