Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CCDC103Q8IW40 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCDC103Q8IW40 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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