Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM69Q86WT6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM69Q86WT6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms