Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L3Q6VB84 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms