Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms