Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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