Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PERM1Q5SV97 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms