Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALFQ53S48 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms