Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms