Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4L6Q3SYB3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms