Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MSMPQ1L6U9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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