Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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