Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA3Q16787 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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