Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NTRK2Q16620 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms