Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK4Q16099 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms