Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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