Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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