Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SYCP1Q15431 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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