Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms