Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms