Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms