Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP1Q13835 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP1Q13835 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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