Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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