Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms