Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTCH1Q13635 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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