Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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