Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms