Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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