Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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FOXI1Q12951 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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FOXI1Q12951 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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FOXI1Q12951 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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FOXI1Q12951 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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FOXI1Q12951 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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