Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms