Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms