Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms