Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms