Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASIC1P78348 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms