Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms