Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
HERVK_113P63121 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms