Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL39P62891 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL39P62891 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms