Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms