Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSEN1P49768 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms